因境内有著名的马祖寺而其名，位于马祖镇东北部，面积286.02公顷，耕地164.2公顷，家庭户859户，常住人口2240人，下辖15个村民小组。村民委员会设于7组境内，马祖寺后侧。
马祖村是我国佛教禅宗第八代祖师马道一的故乡。马祖寺最早建于明万历年间，清乾隆十四年重建。2005年8月17日，“马祖文化节”在马祖村隆重开幕，同一天，该镇也正式更名为马祖镇。从2006年开始，按照市委、市政府规划要求，马祖故里建设将以马祖村为重点全面启动。
马祖村农业结构调整成效显著，是该镇“党员先锋工程食用菌示范基地”，是远近闻名的食用菌种植之乡，群众生活富裕。马祖村还专门成立了一支文艺表演队伍，极大的丰富了广大群众的精神文化生活。
马祖村与复兴村、东岳村、京什社区、马高桥村、邓通村、场镇社区、白沙村、静安村、场镇社区、白鱼河村、亭江村、青龙村、万缘村、东林村相邻。
2011年12月20日，马祖村上榜第三届全国文明村镇名单。
马祖村附近有花信箭台、慧剑寺、什邡西部惊奇欢乐谷、什邡市博物馆、什邡龙居寺等旅游景点，有红白豆腐干、马井挂面、红白但氏豆腐、什邡晒烟、什邡荞面等特产。