南湾湖曾名妮姑湖，为6.6平方千米荒洲，位于大通湖之中。1961年，围湖造田成为军垦农场，东邻四季红与大通湖农场，西接千山红农场，面积42平方千米。2000年，益阳农场体制改革，南湾湖军垦农场与大通湖农场、大通湖渔场、北洲子农场、金盆农场、千山红农场一道，撤场建镇设区，成立大通湖区。
2000年9月成立大通湖区南湾湖办事处，以南湾湖军垦农场的管辖地域为南湾湖办事处的管辖范围，总面积40平方千米。办事处驻肖公庙。财政、税收由湖南省军区南湾湖农副业基地自行管理，未纳入大通湖区财政体系。辖区耕地面积30413亩，总人口2290人。